283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0989 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.77 
 
 
259 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.77 
 
 
261 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.77 
 
 
261 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.08 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.6 
 
 
269 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.71 
 
 
260 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.46 
 
 
258 aa  234  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.95 
 
 
287 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.72 
 
 
259 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.15 
 
 
259 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.15 
 
 
273 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.74 
 
 
260 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  47.1 
 
 
262 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  45.35 
 
 
262 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.27 
 
 
262 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.23 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.32 
 
 
266 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.28 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.07 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.82 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.38 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 
262 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.4 
 
 
262 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.32 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.19 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.18 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.82 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.89 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.42 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.82 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  43.92 
 
 
264 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.88 
 
 
262 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.27 
 
 
275 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  42.97 
 
 
261 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.4 
 
 
264 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  42.97 
 
 
261 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  40.98 
 
 
265 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.92 
 
 
263 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.83 
 
 
260 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.12 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.95 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.84 
 
 
261 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  41.35 
 
 
263 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.03 
 
 
270 aa  192  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.22 
 
 
267 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.64 
 
 
263 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
263 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.57 
 
 
273 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.33 
 
 
275 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.51 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.38 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.42 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.15 
 
 
281 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.91 
 
 
263 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.07 
 
 
273 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  42.86 
 
 
266 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.01 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.57 
 
 
268 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.02 
 
 
300 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.1 
 
 
266 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.49 
 
 
267 aa  168  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.02 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.63 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.14 
 
 
264 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  42.57 
 
 
210 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.74 
 
 
265 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.34 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  34.05 
 
 
251 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.76 
 
 
266 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  33.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.33 
 
 
302 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.88 
 
 
299 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.97 
 
 
298 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.05 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.17 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.2 
 
 
298 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.94 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.92 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.94 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  30.63 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.29 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  33.76 
 
 
297 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.99 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  32.53 
 
 
183 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31.25 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  31 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.37 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  28.57 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.94 
 
 
292 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.03 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.04 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  31.91 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.03 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.03 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>