277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1124 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.95 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 270 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.78 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.06 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  50.19 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  50.77 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.8 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.03 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.01 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.72 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.37 
 
 		 273 aa  248  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.94 
 
 		 266 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.94 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.3 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.99 
 
 		 266 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.35 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.72 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.74 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.8 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.18 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.98 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.18 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.51 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  46.97 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.99 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.24 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.9 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  46.21 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.67 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.21 
 
 		 263 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  46.09 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  46.48 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.93 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 		 268 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  43.36 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  43.75 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.9 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.63 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 		 262 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  41.7 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.8 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.26 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.58 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.25 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.48 
 
 		 273 aa  197  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.68 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.65 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.89 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  41.91 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  43.12 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.94 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.49 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.83 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.95 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.45 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.59 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.87 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  38.02 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.45 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.66 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.58 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  36.73 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.15 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  40.98 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  34.76 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.91 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.7 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.3 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.6 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  28.67 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.48 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.9 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.09 
 
 		 299 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.69 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.59 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.21 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  27.85 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.19 
 
 		 289 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.21 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.18 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  33.78 
 
 		 183 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  29.2 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  28.83 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.87 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.18 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.11 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.6 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.52 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.74 
 
 		 292 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.36 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.778607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>