279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02191 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  62.36 
 
 
263 aa  349  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.82 
 
 
270 aa  345  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  60.45 
 
 
270 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.05 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  54.79 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  54.75 
 
 
263 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.68 
 
 
281 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.85 
 
 
300 aa  260  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.98 
 
 
269 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.77 
 
 
259 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.97 
 
 
259 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.87 
 
 
259 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.61 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.48 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.8 
 
 
262 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.86 
 
 
273 aa  218  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.21 
 
 
264 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.28 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  44.11 
 
 
264 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.42 
 
 
264 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.46 
 
 
258 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.59 
 
 
262 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.16 
 
 
281 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.33 
 
 
262 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.97 
 
 
273 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.24 
 
 
275 aa  205  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.59 
 
 
261 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 
263 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.06 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.26 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.44 
 
 
261 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.43 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.53 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  41.35 
 
 
263 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.21 
 
 
260 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.98 
 
 
273 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  42.69 
 
 
262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.79 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  42.31 
 
 
262 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.63 
 
 
277 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.26 
 
 
262 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.83 
 
 
264 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  38.7 
 
 
261 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.02 
 
 
260 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  38.31 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.79 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  38.95 
 
 
265 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.11 
 
 
275 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.04 
 
 
266 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.2 
 
 
266 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.98 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  39.77 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.08 
 
 
263 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.23 
 
 
263 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.74 
 
 
268 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.89 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.99 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.25 
 
 
261 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.96 
 
 
271 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.01 
 
 
273 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.92 
 
 
277 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.32 
 
 
264 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  37.41 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  35.06 
 
 
266 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.71 
 
 
264 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  37.75 
 
 
210 aa  129  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.96 
 
 
282 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.79 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.06 
 
 
292 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.74 
 
 
292 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  33.06 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  31.91 
 
 
251 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.02 
 
 
266 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.61 
 
 
283 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.89 
 
 
278 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.47 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.46 
 
 
299 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  28.23 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.07 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.27 
 
 
302 aa  95.1  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
292 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  30.24 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.75 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.05 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.43 
 
 
302 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.45 
 
 
298 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.74 
 
 
298 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  29.76 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.2 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.06 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>