288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2754 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  87.84 
 
 
298 aa  544  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.11 
 
 
293 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.34 
 
 
293 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.72 
 
 
293 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  52.22 
 
 
293 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.31 
 
 
305 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.19 
 
 
294 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.19 
 
 
294 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.53 
 
 
294 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.69 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  51.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  51.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.69 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  51.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  51.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  51.34 
 
 
298 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.02 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.02 
 
 
293 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.02 
 
 
296 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.49 
 
 
296 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  43.88 
 
 
292 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.52 
 
 
292 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.18 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.84 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.76 
 
 
292 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.56 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.43 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  42.96 
 
 
280 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.52 
 
 
280 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.43 
 
 
291 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.44 
 
 
311 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.11 
 
 
291 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.97 
 
 
280 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.03 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.15 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.96 
 
 
304 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.61 
 
 
276 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.4 
 
 
280 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  44.33 
 
 
278 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.03 
 
 
279 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.98 
 
 
281 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.98 
 
 
281 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.19 
 
 
279 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.96 
 
 
278 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  37.01 
 
 
296 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.25 
 
 
283 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.84 
 
 
279 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.07 
 
 
276 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.55 
 
 
283 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.16 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.06 
 
 
319 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.6 
 
 
285 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.14 
 
 
310 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.49 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
340 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  37.16 
 
 
293 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  40.75 
 
 
278 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  40.75 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.8 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.6 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.38 
 
 
276 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.79 
 
 
290 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.71 
 
 
239 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.03 
 
 
279 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.89 
 
 
291 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.74 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33 
 
 
313 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33 
 
 
313 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.04 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.15 
 
 
302 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.29 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.89 
 
 
296 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.31 
 
 
290 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.1 
 
 
294 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.61 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.8 
 
 
304 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.56 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.55 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.8 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.51 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.12 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  37.5 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.6 
 
 
307 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.35 
 
 
285 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.03 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.5 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.45 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.52 
 
 
289 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.77 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.64 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.77 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.12 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.51 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.51 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.6 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.1 
 
 
286 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.72 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  32.65 
 
 
285 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>