278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2134 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.95 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.89 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.61 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  52.85 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.76 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.21 
 
 		 275 aa  255  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  49.81 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.32 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.78 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.87 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.24 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.38 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.59 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.36 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.25 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.44 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.3 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.31 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  47.92 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.31 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  47.55 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.07 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.19 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.67 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.15 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.12 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.76 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.86 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  44.87 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.19 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.38 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.7 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.98 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.94 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.08 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.42 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.44 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.22 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.59 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  42.91 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.59 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  39.62 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.16 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  39.62 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  40.75 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.11 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.65 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.94 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.11 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.85 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  42.18 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.88 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.2 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.19 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.98 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.77 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.32 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.22 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.48 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  40.15 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.08 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.97 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  40.49 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.23 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  32.93 
 
 		 251 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  36.97 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.48 
 
 		 302 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  32.02 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.79 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.18 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.02 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.55 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  95.9  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  29.32 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.64 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  33.76 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.64 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.66 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.47 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.55 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.88 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.19 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.57 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  32.03 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.23 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  32.03 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.57 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  33.57 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.8 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.94 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>