290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1448 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  40.8 
 
 
292 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.34 
 
 
292 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.66 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.75 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.31 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  35.64 
 
 
296 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.89 
 
 
290 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.28 
 
 
302 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.55 
 
 
304 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.01 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.46 
 
 
293 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.8 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.33 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  40.91 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.85 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.59 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.59 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.21 
 
 
280 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.08 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.21 
 
 
276 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  41.24 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.98 
 
 
280 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.4 
 
 
276 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.24 
 
 
294 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.07 
 
 
283 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.08 
 
 
305 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  36.88 
 
 
300 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.21 
 
 
278 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.54 
 
 
293 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.42 
 
 
292 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.72 
 
 
304 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.73 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.93 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.28 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.73 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.95 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  39.73 
 
 
299 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.82 
 
 
291 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  39.73 
 
 
299 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  39.73 
 
 
299 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  39.73 
 
 
299 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.41 
 
 
313 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.38 
 
 
299 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.41 
 
 
313 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.33 
 
 
278 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.24 
 
 
276 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.42 
 
 
311 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  39.48 
 
 
278 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  39.48 
 
 
278 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.88 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.73 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.03 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.75 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  39.11 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  39.11 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.49 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.33 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  35.06 
 
 
305 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.52 
 
 
289 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.72 
 
 
296 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.13 
 
 
305 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.72 
 
 
331 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.69 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.5 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.29 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.89 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.64 
 
 
281 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.64 
 
 
281 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0605  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.64 
 
 
296 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.04 
 
 
303 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  34.87 
 
 
300 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.69 
 
 
276 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.1 
 
 
302 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.85 
 
 
318 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  34.45 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.77 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  37.75 
 
 
301 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  37.31 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  33.89 
 
 
297 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.58 
 
 
289 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.89 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  33.89 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.05 
 
 
276 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.45 
 
 
287 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  37.31 
 
 
278 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.39 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.25 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.81 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  36.01 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  33.89 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 
315 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.02 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.59 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.78 
 
 
292 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.29 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.78 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>