210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0927 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  87.5 
 
 		 266 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  59.76 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.83 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  48.07 
 
 		 183 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.76 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.22 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.73 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.48 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  36.02 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  36.6 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  31.65 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.22 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.05 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.35 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.9 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.04 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.51 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.62 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.02 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.93 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.94 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  33.62 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  31.95 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.74 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.04 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.34 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.87 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.61 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.43 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.28 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.99 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.83 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  32.16 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.77 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.79 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.38 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.19 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.02 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  30.92 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.63 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.88 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  33.06 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  28.98 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.03 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  30.94 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.34 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.73 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.77 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.29 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  29.23 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.84 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.81 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.63 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.12 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.08 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.81 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.75 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.09 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.38 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.4 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  28.51 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.63 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.51 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.03 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  29.1 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.48 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  29.06 
 
 		 210 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.91 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.42 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.64 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  24.69 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.61 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  26.19 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.93 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.19 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.56 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.98 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  24.65 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.98 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.86 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.11 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  24.19 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  25.78 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.5 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.5 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.32 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.7 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.94 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  24.24 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>