270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4574 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
260 aa  533  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.38 
 
 
258 aa  222  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.15 
 
 
281 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.08 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.98 
 
 
263 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.29 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.77 
 
 
261 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.83 
 
 
287 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.89 
 
 
270 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.87 
 
 
259 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.77 
 
 
259 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.27 
 
 
264 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.96 
 
 
262 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.49 
 
 
266 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.25 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.14 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  41.83 
 
 
263 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.63 
 
 
260 aa  198  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.91 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.3 
 
 
260 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.8 
 
 
273 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  40.93 
 
 
261 aa  191  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.04 
 
 
269 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.9 
 
 
267 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.47 
 
 
262 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.76 
 
 
275 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  41.09 
 
 
264 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.69 
 
 
262 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  40.54 
 
 
261 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.44 
 
 
264 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.61 
 
 
277 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  40.7 
 
 
262 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  40.31 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.18 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.98 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.29 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  43.02 
 
 
263 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.39 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.23 
 
 
264 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.87 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.42 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.15 
 
 
263 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  41.04 
 
 
265 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.24 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.8 
 
 
258 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.7 
 
 
277 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.15 
 
 
263 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  39.85 
 
 
266 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.68 
 
 
267 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.33 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.52 
 
 
273 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.59 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.3 
 
 
300 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  39.63 
 
 
266 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  38.66 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.62 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  38.85 
 
 
261 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.16 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.86 
 
 
273 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.55 
 
 
261 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.55 
 
 
268 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.37 
 
 
281 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.33 
 
 
271 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  37.88 
 
 
263 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  38.28 
 
 
210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.47 
 
 
265 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.01 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  35.54 
 
 
251 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  35.83 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.02 
 
 
302 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.05 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.93 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.19 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  30.11 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  33.77 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.43 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  34.05 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  33.77 
 
 
297 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.44 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.21 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.86 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.2 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.8 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.77 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.55 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.17 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  29.49 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.79 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.24 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.47 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>