272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1103 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
277 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
259 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.86 
 
 
263 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  49.25 
 
 
259 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.69 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50 
 
 
273 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.13 
 
 
261 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
263 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  43.07 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.39 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.33 
 
 
266 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.33 
 
 
259 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.72 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.01 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.08 
 
 
270 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.62 
 
 
264 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.63 
 
 
264 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.37 
 
 
271 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
262 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.06 
 
 
263 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.24 
 
 
260 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.15 
 
 
268 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.11 
 
 
264 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
262 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
262 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50 
 
 
266 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.21 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.48 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.82 
 
 
266 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.62 
 
 
281 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.49 
 
 
269 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.19 
 
 
277 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  41.73 
 
 
262 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.44 
 
 
270 aa  194  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  41.35 
 
 
262 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.16 
 
 
267 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.45 
 
 
266 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.29 
 
 
273 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  39.63 
 
 
263 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.75 
 
 
262 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.61 
 
 
260 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  39.7 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.9 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.78 
 
 
264 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  38.81 
 
 
265 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.26 
 
 
273 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.78 
 
 
267 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  38.58 
 
 
261 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.59 
 
 
263 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.52 
 
 
300 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.71 
 
 
263 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.89 
 
 
287 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.61 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  38.2 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.02 
 
 
261 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.17 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.73 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.92 
 
 
262 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.82 
 
 
273 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.69 
 
 
268 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.05 
 
 
266 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.45 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.41 
 
 
275 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  37.96 
 
 
266 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.07 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.94 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  37.44 
 
 
210 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.45 
 
 
282 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  32.77 
 
 
279 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.49 
 
 
266 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  31.06 
 
 
251 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.62 
 
 
299 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.28 
 
 
302 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.74 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.03 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.84 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.56 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.83 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.11 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.54 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  34.25 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.86 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.11 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.18 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.16 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.64 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  30.82 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.45 
 
 
315 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.65 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.77 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.33 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  33.04 
 
 
301 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.17 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.57 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.3 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  27.51 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.77 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>