282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4529 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  69.73 
 
 
261 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  70.11 
 
 
261 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  65.3 
 
 
268 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.78 
 
 
258 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.58 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  49.81 
 
 
259 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.3 
 
 
259 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 
262 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 
262 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.28 
 
 
261 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.85 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  47.71 
 
 
263 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51 
 
 
263 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.19 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.88 
 
 
264 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.51 
 
 
287 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.62 
 
 
281 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.49 
 
 
262 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.23 
 
 
260 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  44.02 
 
 
261 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  44.02 
 
 
261 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.9 
 
 
258 aa  218  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.07 
 
 
273 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.21 
 
 
266 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.48 
 
 
262 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.97 
 
 
266 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.35 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.01 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  44.02 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.21 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  43.8 
 
 
262 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 
270 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.03 
 
 
267 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.3 
 
 
267 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  43.8 
 
 
262 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.26 
 
 
275 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.59 
 
 
262 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.7 
 
 
264 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.36 
 
 
263 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.24 
 
 
277 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.4 
 
 
275 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  41.73 
 
 
265 aa  201  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.65 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.74 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.61 
 
 
273 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.01 
 
 
270 aa  199  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.63 
 
 
260 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  43.56 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.26 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.86 
 
 
300 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.68 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.49 
 
 
273 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  42.21 
 
 
263 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.35 
 
 
263 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  42.16 
 
 
266 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  38.08 
 
 
261 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.23 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.28 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.2 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.18 
 
 
273 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.93 
 
 
266 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.93 
 
 
268 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  40.1 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.83 
 
 
264 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
277 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.25 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.79 
 
 
265 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.44 
 
 
264 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  38.22 
 
 
279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.44 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  36.44 
 
 
251 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.96 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.94 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  33.81 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.36 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
298 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.65 
 
 
276 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
299 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  38.36 
 
 
183 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.04 
 
 
290 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.27 
 
 
280 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.37 
 
 
299 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.03 
 
 
291 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.27 
 
 
294 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.06 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  32.33 
 
 
300 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  29.31 
 
 
292 aa  99  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.77 
 
 
300 aa  99  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.58 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.02 
 
 
273 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.97 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.23 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.46 
 
 
340 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.18 
 
 
289 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.23 
 
 
302 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.5 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.24 
 
 
292 aa  92  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  28.91 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>