276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4473 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
277 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.22 
 
 
263 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.69 
 
 
259 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.19 
 
 
277 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.57 
 
 
259 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.31 
 
 
262 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.69 
 
 
262 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.69 
 
 
262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.15 
 
 
275 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45 
 
 
261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.65 
 
 
262 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.08 
 
 
262 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.21 
 
 
263 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  39.38 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.07 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.46 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.7 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.85 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  39.93 
 
 
262 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.37 
 
 
287 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  38.75 
 
 
264 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  39.93 
 
 
262 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  43.66 
 
 
265 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.06 
 
 
267 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.75 
 
 
258 aa  178  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.46 
 
 
260 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.59 
 
 
264 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.01 
 
 
261 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.7 
 
 
260 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.27 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.64 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.03 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.39 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.53 
 
 
264 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.66 
 
 
259 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.55 
 
 
260 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.38 
 
 
270 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.96 
 
 
266 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.39 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.13 
 
 
261 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.4 
 
 
264 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.85 
 
 
263 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.04 
 
 
271 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.06 
 
 
262 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  36.19 
 
 
261 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.89 
 
 
266 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.76 
 
 
273 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.89 
 
 
266 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.41 
 
 
270 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  37.92 
 
 
263 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.87 
 
 
264 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.32 
 
 
270 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.79 
 
 
273 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.29 
 
 
263 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.41 
 
 
300 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.38 
 
 
263 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.63 
 
 
263 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
281 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  37.41 
 
 
266 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  35.14 
 
 
261 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  34.75 
 
 
261 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.21 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.02 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.66 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.15 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.65 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  36.92 
 
 
210 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.51 
 
 
265 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  34.75 
 
 
266 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  32.85 
 
 
297 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  32.85 
 
 
297 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.48 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.53 
 
 
299 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.71 
 
 
302 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  32.85 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.51 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  32.48 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  33.91 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  33.91 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  33.05 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  33.48 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  33.48 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.01 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.6 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.71 
 
 
282 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.91 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  29.51 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.52 
 
 
298 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.76 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.86 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.66 
 
 
292 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  33.45 
 
 
280 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  31.51 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.34 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.21 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.16 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  30.9 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.21 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>