269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2334 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  54.68 
 
 
263 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.51 
 
 
270 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.31 
 
 
263 aa  298  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.02 
 
 
270 aa  295  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.76 
 
 
267 aa  284  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.94 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  52.06 
 
 
263 aa  268  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46 
 
 
300 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 
259 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.07 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.24 
 
 
275 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.48 
 
 
273 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.67 
 
 
259 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.33 
 
 
269 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  43.02 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.65 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  43.02 
 
 
262 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.26 
 
 
266 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.22 
 
 
281 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.81 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.33 
 
 
262 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.51 
 
 
266 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.16 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.2 
 
 
261 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.24 
 
 
268 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.16 
 
 
262 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.15 
 
 
266 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.48 
 
 
264 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
260 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.89 
 
 
262 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.95 
 
 
260 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.78 
 
 
273 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  40.15 
 
 
263 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.38 
 
 
261 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.02 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
261 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.26 
 
 
266 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.45 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.69 
 
 
258 aa  178  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.73 
 
 
287 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.61 
 
 
277 aa  178  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.3 
 
 
262 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.38 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  37.69 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.07 
 
 
273 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  35.27 
 
 
261 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.13 
 
 
267 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.37 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.17 
 
 
264 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  37.45 
 
 
265 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.89 
 
 
275 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.92 
 
 
277 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.84 
 
 
263 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.43 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  37.09 
 
 
266 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
258 aa  149  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.08 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 
265 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.87 
 
 
268 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  31.95 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  35.77 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.2 
 
 
264 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.48 
 
 
264 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  33.82 
 
 
266 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.51 
 
 
261 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  34.32 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.91 
 
 
278 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.61 
 
 
282 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  29.84 
 
 
279 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.16 
 
 
266 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 
292 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.34 
 
 
292 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  33.18 
 
 
210 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.23 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.51 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.65 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.62 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.57 
 
 
283 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  30.63 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.66 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.27 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.62 
 
 
298 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.75 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  28.97 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.11 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.55 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.82 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31.41 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  31.41 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.22 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.17 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.67 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.05 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  30.34 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  32.14 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.75 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>