271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3143 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.91 
 
 
264 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  52.69 
 
 
259 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.54 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.32 
 
 
281 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 
262 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.89 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 
262 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 
259 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.24 
 
 
262 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
262 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.38 
 
 
261 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  49.62 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.28 
 
 
261 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.28 
 
 
261 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.49 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  47.33 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  47.33 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.72 
 
 
262 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.12 
 
 
266 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.3 
 
 
266 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.42 
 
 
273 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.55 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.48 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.24 
 
 
262 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.72 
 
 
275 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.69 
 
 
258 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.44 
 
 
269 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.99 
 
 
266 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.8 
 
 
273 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  46.74 
 
 
263 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.41 
 
 
262 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.23 
 
 
260 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  48.48 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  41.54 
 
 
261 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  41.86 
 
 
261 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  43.61 
 
 
265 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.72 
 
 
277 aa  214  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  48.7 
 
 
266 aa  214  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.14 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.63 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.7 
 
 
264 aa  208  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.48 
 
 
268 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  42.8 
 
 
263 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.41 
 
 
268 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.62 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.56 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.96 
 
 
270 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.32 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.61 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.3 
 
 
260 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.03 
 
 
273 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.72 
 
 
300 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.77 
 
 
261 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.85 
 
 
263 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  42.75 
 
 
266 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.36 
 
 
263 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  45.19 
 
 
266 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.83 
 
 
264 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.95 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.85 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.78 
 
 
273 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  41.7 
 
 
261 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.46 
 
 
277 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.11 
 
 
264 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.97 
 
 
271 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.23 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.88 
 
 
265 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  34.75 
 
 
251 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.34 
 
 
302 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  38.92 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  34.73 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.89 
 
 
266 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.27 
 
 
298 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.67 
 
 
301 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  31.44 
 
 
300 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  30.67 
 
 
300 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.55 
 
 
299 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.88 
 
 
299 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.43 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.33 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.29 
 
 
278 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.99 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.97 
 
 
302 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  33.33 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  29.11 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.6 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.43 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.19 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.54 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.62 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.86 
 
 
280 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.28 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.92 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.38 
 
 
315 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.75 
 
 
305 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.35 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  29.08 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.45 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>