276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.2 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.9 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  48.06 
 
 		 210 aa  205  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.05 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.41 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.65 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  43.72 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  39.84 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.02 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.77 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.65 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.64 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.41 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  40.86 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.05 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  40.08 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  40.77 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.86 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.87 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.25 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.7 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.48 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.08 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.22 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.25 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.48 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.6 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.38 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.68 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.34 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.47 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.57 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.98 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.2 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  35.77 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.02 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.53 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.02 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  34.96 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.23 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.05 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.13 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  37.25 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  38.46 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  34.51 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.55 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.84 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.74 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.29 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.3 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.77 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  36.58 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.22 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.77 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.68 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  35.61 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.8 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.6 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.19 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.92 
 
 		 263 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.07 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  34.48 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.92 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  34.76 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.32 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.46 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.12 
 
 		 302 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  29.34 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.19 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.09 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.98 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05060  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.85 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.5 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.25 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  29.79 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.52 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.52 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  27.96 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.02 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.43 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.9 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.14 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.53 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.96 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.9 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.91 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.82 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.3 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.45 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.82 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.2 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.52 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.25 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.15 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>