286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1761 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  99.66 
 
 
297 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  99.66 
 
 
297 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  98.99 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  98.99 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  81.82 
 
 
297 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  81.69 
 
 
297 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  81.48 
 
 
297 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  81.48 
 
 
297 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  81.48 
 
 
297 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  81.69 
 
 
297 aa  507  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  50.87 
 
 
300 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  47.32 
 
 
300 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  46.33 
 
 
301 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  46.96 
 
 
315 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.03 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  33.22 
 
 
299 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.89 
 
 
299 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.59 
 
 
302 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.7 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.55 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.89 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.55 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.93 
 
 
299 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.44 
 
 
299 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.14 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.44 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.12 
 
 
299 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.25 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.68 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.57 
 
 
287 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.42 
 
 
295 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
291 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
315 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.54 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  37.45 
 
 
266 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.62 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.43 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.53 
 
 
292 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.43 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.18 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31 
 
 
268 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.64 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.04 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.67 
 
 
273 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.39 
 
 
307 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.47 
 
 
285 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.47 
 
 
285 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.62 
 
 
273 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.47 
 
 
285 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30 
 
 
304 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.15 
 
 
292 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  34.04 
 
 
266 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.42 
 
 
285 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.51 
 
 
292 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.12 
 
 
285 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.39 
 
 
283 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  31.29 
 
 
266 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.14 
 
 
283 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.68 
 
 
275 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.12 
 
 
302 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.94 
 
 
290 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.39 
 
 
305 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  30.53 
 
 
286 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.13 
 
 
280 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
261 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.64 
 
 
269 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.54 
 
 
278 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.12 
 
 
285 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  29.27 
 
 
259 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.77 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.74 
 
 
289 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.6 
 
 
261 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.4 
 
 
278 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.56 
 
 
292 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.17 
 
 
288 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.43 
 
 
292 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.5 
 
 
262 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  27.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.35 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.82 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  31.88 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.66 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1309  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.57 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6520  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.57 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.1 
 
 
267 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4651  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.07 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.79 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6122  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.23 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.06 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.22 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  30.88 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.04 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.84 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>