276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3504 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.72 
 
 
264 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.32 
 
 
260 aa  271  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.06 
 
 
259 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.32 
 
 
259 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  51.32 
 
 
259 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.47 
 
 
269 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.22 
 
 
270 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.44 
 
 
263 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  47.17 
 
 
264 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.86 
 
 
262 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  52.42 
 
 
266 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.71 
 
 
262 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.44 
 
 
262 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.03 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  46.21 
 
 
262 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  45.83 
 
 
262 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.82 
 
 
262 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.07 
 
 
262 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 
261 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.66 
 
 
266 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.35 
 
 
262 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.1 
 
 
287 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.62 
 
 
260 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.62 
 
 
273 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.38 
 
 
261 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
261 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.27 
 
 
258 aa  221  8e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.7 
 
 
266 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.74 
 
 
268 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  41.6 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  41.06 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.15 
 
 
260 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.59 
 
 
275 aa  214  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.68 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  43.82 
 
 
263 aa  212  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.57 
 
 
264 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  42.16 
 
 
263 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.96 
 
 
273 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.05 
 
 
261 aa  203  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.85 
 
 
275 aa  198  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.32 
 
 
262 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.33 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.62 
 
 
277 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.97 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.61 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.36 
 
 
270 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.75 
 
 
263 aa  188  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.01 
 
 
281 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.27 
 
 
270 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.28 
 
 
263 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.43 
 
 
300 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.52 
 
 
263 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  39.1 
 
 
265 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  39.55 
 
 
263 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.85 
 
 
273 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.76 
 
 
266 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.75 
 
 
264 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.91 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.68 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.03 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  36.4 
 
 
261 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.67 
 
 
263 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.76 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.46 
 
 
268 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  38.24 
 
 
266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  38.97 
 
 
266 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.46 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  38.28 
 
 
210 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.76 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  33.48 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  33.78 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.2 
 
 
266 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.03 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.94 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
298 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.82 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.15 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.37 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  30.48 
 
 
183 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.65 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  30.45 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.52 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.13 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.92 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.19 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.44 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  32.27 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.37 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.85 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.63 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.15 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.61 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.75 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.92 
 
 
340 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  32.71 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.32 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.7 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>