92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04947 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04947  epimerase  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.8 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  50.82 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  48.07 
 
 		 279 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.74 
 
 		 266 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.36 
 
 		 260 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.57 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  35.23 
 
 		 259 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.73 
 
 		 261 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 260 aa  94.4  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.73 
 
 		 261 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  32.53 
 
 		 263 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.09 
 
 		 259 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 		 259 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.88 
 
 		 258 aa  87.8  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.91 
 
 		 258 aa  87  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  32.54 
 
 		 265 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.74 
 
 		 266 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.12 
 
 		 287 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.62 
 
 		 264 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.48 
 
 		 281 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.44 
 
 		 275 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.08 
 
 		 263 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.21 
 
 		 261 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.74 
 
 		 266 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.88 
 
 		 262 aa  84.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.65 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.75 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.74 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.43 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.25 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.81 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.14 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.73 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  41.75 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.16 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.36 
 
 		 275 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.03 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.74 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.84 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  31.55 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  33.56 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.71 
 
 		 262 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.82 
 
 		 262 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.68 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.96 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.44 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.38 
 
 		 282 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.14 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.46 
 
 		 263 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.35 
 
 		 267 aa  71.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.55 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.5 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.04 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.26 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.14 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  26.63 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.21 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.27 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.45 
 
 		 273 aa  67.8  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  30.99 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.04 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.12 
 
 		 267 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.78 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.44 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.07 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  29.6 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  34.58 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  24.7 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.24 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.78 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.79 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 		 340 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 281 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  32.14 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.14 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.95 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.37 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.52 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.5 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.5 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.5 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.5 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.25 
 
 		 285 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.29 
 
 		 300 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 		 278 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 		 278 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31872  predicted protein  34.85 
 
 		 382 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.888244  normal  0.28032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>