275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2672 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 		 262 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  62.87 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.2 
 
 		 269 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.02 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.67 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  53.08 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.72 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.86 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.15 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.72 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  50.58 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.94 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.58 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.15 
 
 		 262 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.19 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.15 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  47.31 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  46.92 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.06 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.39 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  46.92 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.49 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.48 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.43 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.06 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.81 
 
 		 266 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.37 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.53 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.39 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  45.56 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  45.38 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.55 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.04 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.51 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.74 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  47.15 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.58 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.53 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.39 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.15 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.65 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.47 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.94 
 
 		 262 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.83 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  43.77 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.94 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.6 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.1 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.53 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.75 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.89 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.91 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.4 
 
 		 263 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.79 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  41.67 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.94 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.23 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  39.18 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.45 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.94 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.06 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.11 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.45 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.7 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  36.55 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.6 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  34.91 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.2 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  35.04 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.94 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.6 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.19 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.07 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.6 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.94 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.87 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.76 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.12 
 
 		 291 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.56 
 
 		 299 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.3 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.57 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  30.3 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.3 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  26.69 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.17 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.3 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.67 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.71 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.44 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  32.08 
 
 		 300 aa  88.6  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.47 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.47 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.6 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  29.92 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  29.06 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>