288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1710 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  97.31 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  96.97 
 
 
297 aa  593  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  96.97 
 
 
297 aa  593  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  96.97 
 
 
297 aa  594  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  96.97 
 
 
297 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  81.82 
 
 
297 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  81.82 
 
 
297 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  81.14 
 
 
297 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  81.48 
 
 
297 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  81.14 
 
 
297 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  52.25 
 
 
300 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  47.32 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  46.33 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  48.31 
 
 
315 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  34.45 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.89 
 
 
299 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.61 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.56 
 
 
299 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.09 
 
 
299 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  34.11 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
299 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
299 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
299 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
299 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.9 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.15 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.89 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.27 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.84 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.71 
 
 
299 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.14 
 
 
296 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.44 
 
 
299 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.89 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.67 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.04 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.44 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.97 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.68 
 
 
298 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.97 
 
 
292 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.99 
 
 
285 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  30.99 
 
 
285 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.99 
 
 
285 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.12 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.34 
 
 
285 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.63 
 
 
285 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  30.38 
 
 
287 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.63 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.51 
 
 
288 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.44 
 
 
278 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.99 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.62 
 
 
292 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.16 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.39 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.1 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.18 
 
 
278 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.17 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.61 
 
 
290 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.14 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.61 
 
 
304 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  31.8 
 
 
266 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  30.69 
 
 
259 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  32.78 
 
 
266 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  32.14 
 
 
278 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  32.14 
 
 
278 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.9 
 
 
268 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.27 
 
 
259 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.51 
 
 
290 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  31.75 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  31.75 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.09 
 
 
314 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.99 
 
 
276 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.62 
 
 
261 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.69 
 
 
302 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.01 
 
 
278 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.7 
 
 
292 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.18 
 
 
273 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  32.48 
 
 
266 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.68 
 
 
307 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.85 
 
 
277 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.56 
 
 
305 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33 
 
 
298 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.93 
 
 
289 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.87 
 
 
299 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.87 
 
 
299 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.22 
 
 
299 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4651  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.47 
 
 
312 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  32.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.74 
 
 
289 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6122  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.36 
 
 
290 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1560  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.19 
 
 
302 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.264367  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  32.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.6 
 
 
265 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
269 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  32.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  32.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.27 
 
 
261 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.55 
 
 
292 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.37 
 
 
292 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>