282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0096 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  60.9 
 
 
263 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.88 
 
 
266 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.02 
 
 
259 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.42 
 
 
262 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.31 
 
 
263 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.75 
 
 
273 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.86 
 
 
275 aa  224  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  52.87 
 
 
259 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.5 
 
 
264 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.09 
 
 
264 aa  214  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.43 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.43 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.19 
 
 
261 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.3 
 
 
260 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.43 
 
 
262 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.19 
 
 
261 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.66 
 
 
261 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.34 
 
 
268 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.29 
 
 
262 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.11 
 
 
258 aa  205  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.71 
 
 
273 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.62 
 
 
273 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.24 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.33 
 
 
281 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  43.68 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.61 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.58 
 
 
269 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.16 
 
 
277 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.67 
 
 
264 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.83 
 
 
262 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.9 
 
 
260 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  41.79 
 
 
263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.93 
 
 
263 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.89 
 
 
259 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.88 
 
 
263 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.42 
 
 
267 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.94 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.13 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.94 
 
 
266 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.62 
 
 
275 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.06 
 
 
277 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.37 
 
 
270 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.88 
 
 
261 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.56 
 
 
266 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  40.39 
 
 
261 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  40.78 
 
 
261 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.29 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.32 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.07 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  40.74 
 
 
266 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.51 
 
 
262 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.26 
 
 
266 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  43.49 
 
 
263 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
268 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  42.42 
 
 
263 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.56 
 
 
270 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  40.3 
 
 
262 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.08 
 
 
258 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  39.92 
 
 
262 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.07 
 
 
265 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.13 
 
 
281 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.16 
 
 
271 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.77 
 
 
261 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.07 
 
 
282 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  39.11 
 
 
210 aa  142  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.7 
 
 
273 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.62 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.23 
 
 
299 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.82 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.62 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.69 
 
 
299 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.88 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  32.51 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.65 
 
 
301 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.25 
 
 
306 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.01 
 
 
292 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.79 
 
 
289 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.99 
 
 
292 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.74 
 
 
302 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.88 
 
 
302 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.17 
 
 
292 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.34 
 
 
305 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.15 
 
 
298 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.49 
 
 
300 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  32.04 
 
 
297 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  30.8 
 
 
297 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.23 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  30.1 
 
 
297 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  30.8 
 
 
297 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.47 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  28.75 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.69 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>