275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1102 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  64.64 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.94 
 
 		 263 aa  325  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.3 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  57.84 
 
 		 270 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  54.79 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.09 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.59 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.94 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.21 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.04 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  44.7 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.63 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.7 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 		 261 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.91 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.18 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.88 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.64 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.15 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.53 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.21 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.59 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.75 
 
 		 262 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.53 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.2 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.16 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  42.15 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  42.64 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  41.76 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.35 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.81 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.52 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.05 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.09 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  38.26 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.98 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.07 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.85 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.71 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.66 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  38.78 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.29 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.23 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.44 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.26 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  39.08 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  35.63 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.67 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  35.47 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.49 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.47 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.62 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.77 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.26 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.71 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.5 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.03 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.29 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.15 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.97 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  36.67 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.92 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.8 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.53 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  34.3 
 
 		 210 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  31.6 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.57 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.12 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  30.38 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.79 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.06 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.84 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.82 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  29.73 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  30.27 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.96 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.25 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.05 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.26 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.91 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.88 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  31.47 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.69 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.4 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  27.84 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.63 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.88 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>