269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0680 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  61.07 
 
 
280 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  61.07 
 
 
280 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  57.86 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.82 
 
 
280 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  59.21 
 
 
278 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  58.84 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.78 
 
 
276 aa  304  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.74 
 
 
279 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.45 
 
 
276 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.07 
 
 
278 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.56 
 
 
291 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.21 
 
 
291 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.14 
 
 
283 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.83 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.2 
 
 
294 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.68 
 
 
285 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.91 
 
 
278 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.39 
 
 
311 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.11 
 
 
340 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.75 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.36 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.81 
 
 
279 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.36 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.91 
 
 
279 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.5 
 
 
279 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.64 
 
 
280 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.9 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.6 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.24 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.45 
 
 
318 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.61 
 
 
276 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.98 
 
 
319 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.93 
 
 
304 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.21 
 
 
239 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.06 
 
 
293 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.05 
 
 
296 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.71 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.05 
 
 
294 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.05 
 
 
294 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  47.44 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.12 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.78 
 
 
299 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.34 
 
 
293 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.7 
 
 
294 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.86 
 
 
298 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.55 
 
 
298 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.71 
 
 
293 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.21 
 
 
293 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.93 
 
 
296 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.87 
 
 
305 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  38.91 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  38.46 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.82 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.93 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.81 
 
 
292 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.15 
 
 
292 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.47 
 
 
292 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.12 
 
 
290 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.5 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.12 
 
 
292 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  34.95 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.08 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.11 
 
 
289 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.76 
 
 
289 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.3 
 
 
286 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.36 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.69 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.19 
 
 
307 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.4 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.78 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.27 
 
 
285 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  35.36 
 
 
286 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.9 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.92 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.88 
 
 
264 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  33.68 
 
 
285 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  35 
 
 
278 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  35 
 
 
278 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.35 
 
 
305 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  31.14 
 
 
297 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  34.64 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  34.64 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.1 
 
 
300 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  31.14 
 
 
297 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  30.83 
 
 
297 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  30.83 
 
 
297 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.68 
 
 
288 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  30.83 
 
 
297 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.68 
 
 
302 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.37 
 
 
297 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.89 
 
 
273 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  32.61 
 
 
263 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.14 
 
 
286 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>