278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4315 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  98.47 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  91.6 
 
 		 262 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  90.08 
 
 		 262 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  64.5 
 
 		 259 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  63.36 
 
 		 259 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.15 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.15 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.52 
 
 		 273 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.91 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.62 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.86 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.62 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.45 
 
 		 275 aa  238  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.15 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.07 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.18 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.62 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.87 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.38 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.36 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  47.89 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  47.51 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.01 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  45.59 
 
 		 264 aa  224  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.12 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.35 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.81 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  44.44 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.43 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  44.53 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.7 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.45 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.68 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  44.44 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.29 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.33 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  41.13 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.24 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.54 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.15 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.29 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.86 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.38 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  40.46 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.11 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.39 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.33 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.36 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.69 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.89 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  37.64 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.01 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.87 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.18 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  43.17 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  39.56 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.13 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.79 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  35.77 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.58 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.91 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.22 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.37 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  35.89 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.18 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.13 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.41 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.07 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.71 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.97 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  29.02 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.57 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.31 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.18 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.06 
 
 		 302 aa  101  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  34.5 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  34.5 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  34.5 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  34.5 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  34.5 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.84 
 
 		 305 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  32.94 
 
 		 300 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.36 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31.08 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.26 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.49 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.28 
 
 		 297 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  30.28 
 
 		 297 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.77 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.01 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.5 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>