280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0793 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
276 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  65.44 
 
 
273 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  67.52 
 
 
280 aa  349  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  62.59 
 
 
283 aa  329  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  59.93 
 
 
280 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  58.48 
 
 
280 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.34 
 
 
278 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.56 
 
 
280 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  61.17 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.78 
 
 
283 aa  304  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.65 
 
 
278 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.06 
 
 
285 aa  295  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  58.24 
 
 
278 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  57.88 
 
 
278 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.67 
 
 
276 aa  290  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.43 
 
 
340 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.98 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.99 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.99 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.2 
 
 
291 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.85 
 
 
291 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  55.8 
 
 
278 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.61 
 
 
294 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.19 
 
 
279 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.2 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.5 
 
 
310 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.73 
 
 
276 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.79 
 
 
331 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.64 
 
 
281 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.64 
 
 
281 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.41 
 
 
318 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.63 
 
 
276 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  58.61 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
279 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.28 
 
 
319 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.65 
 
 
293 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  50 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  50 
 
 
298 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.3 
 
 
294 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.65 
 
 
299 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.94 
 
 
294 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.94 
 
 
294 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.78 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.4 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.52 
 
 
293 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.64 
 
 
305 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.71 
 
 
292 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.72 
 
 
293 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.1 
 
 
292 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.67 
 
 
293 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.4 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.4 
 
 
292 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  44.79 
 
 
292 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.37 
 
 
296 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.61 
 
 
298 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.92 
 
 
298 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  39.39 
 
 
296 aa  190  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.9 
 
 
290 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.4 
 
 
291 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.98 
 
 
292 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  37.72 
 
 
293 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.26 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.79 
 
 
289 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.22 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  38.37 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.23 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.89 
 
 
302 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.36 
 
 
285 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.27 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.7 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.15 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.97 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.64 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.64 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.18 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  35.77 
 
 
278 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  35.77 
 
 
278 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.66 
 
 
264 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.59 
 
 
307 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.59 
 
 
286 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.01 
 
 
305 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  34.83 
 
 
278 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  34.83 
 
 
278 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.35 
 
 
297 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.82 
 
 
279 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  31.99 
 
 
297 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.79 
 
 
290 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.8 
 
 
296 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  31.99 
 
 
297 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.89 
 
 
309 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
263 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  31.62 
 
 
297 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.65 
 
 
278 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  31.62 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>