276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.85 
 
 
280 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  58.01 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.79 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.29 
 
 
276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  56.89 
 
 
280 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.29 
 
 
273 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.21 
 
 
291 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.21 
 
 
291 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.06 
 
 
276 aa  295  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.03 
 
 
278 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.63 
 
 
294 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  53.96 
 
 
278 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.33 
 
 
331 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.49 
 
 
311 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.16 
 
 
310 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.96 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.68 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.05 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.24 
 
 
319 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.82 
 
 
279 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  50.18 
 
 
278 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  49.82 
 
 
278 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.87 
 
 
279 aa  255  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.77 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.47 
 
 
340 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.88 
 
 
276 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.12 
 
 
280 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.23 
 
 
276 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.76 
 
 
304 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.13 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  54.66 
 
 
239 aa  238  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.42 
 
 
281 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.42 
 
 
281 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.79 
 
 
279 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.85 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.85 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.69 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.39 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.29 
 
 
293 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.45 
 
 
293 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.76 
 
 
296 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.42 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.36 
 
 
292 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.01 
 
 
292 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.24 
 
 
305 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.81 
 
 
292 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.99 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.99 
 
 
299 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  46.32 
 
 
298 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  42.56 
 
 
292 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.58 
 
 
292 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.79 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.74 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.6 
 
 
298 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.4 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.47 
 
 
293 aa  175  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  38.19 
 
 
296 aa  169  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.07 
 
 
290 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.7 
 
 
293 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.36 
 
 
292 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.88 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.94 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.53 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.93 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.38 
 
 
286 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.01 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  38.17 
 
 
286 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.69 
 
 
279 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.28 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.1 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.39 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.89 
 
 
309 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.9 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.93 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.46 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.24 
 
 
286 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.24 
 
 
286 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.44 
 
 
302 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.96 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  34.8 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.39 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.62 
 
 
307 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.89 
 
 
278 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.67 
 
 
302 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.55 
 
 
313 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.55 
 
 
313 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.47 
 
 
300 aa  105  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.78 
 
 
302 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.13 
 
 
306 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.79 
 
 
289 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.89 
 
 
288 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.12 
 
 
296 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.29 
 
 
307 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>