273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3119 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  99.31 
 
 
291 aa  577  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  82.65 
 
 
294 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.22 
 
 
278 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  59.38 
 
 
280 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.6 
 
 
311 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  54.21 
 
 
318 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.54 
 
 
273 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  54.92 
 
 
280 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  54.64 
 
 
280 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.21 
 
 
285 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.9 
 
 
276 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.44 
 
 
283 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.74 
 
 
331 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.97 
 
 
279 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.72 
 
 
310 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.1 
 
 
279 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.21 
 
 
283 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  52.23 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.53 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  53.47 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.47 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.2 
 
 
276 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.24 
 
 
278 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.71 
 
 
279 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.25 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  58.17 
 
 
239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.55 
 
 
304 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.79 
 
 
276 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  50.87 
 
 
278 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  51.21 
 
 
278 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.53 
 
 
279 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.82 
 
 
276 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.6 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.14 
 
 
296 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.81 
 
 
276 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.34 
 
 
305 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  49.83 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.17 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.17 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.12 
 
 
293 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.84 
 
 
294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.55 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.97 
 
 
293 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.96 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.78 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  47.78 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.78 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.78 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.78 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.78 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.44 
 
 
299 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.66 
 
 
296 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.11 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.75 
 
 
293 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  44.48 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.11 
 
 
293 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.67 
 
 
298 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.36 
 
 
292 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.02 
 
 
292 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.68 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.97 
 
 
292 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.74 
 
 
290 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  35.62 
 
 
296 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.82 
 
 
291 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.09 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.81 
 
 
293 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.08 
 
 
278 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.48 
 
 
307 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.87 
 
 
289 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.46 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.13 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.88 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.54 
 
 
307 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  35.2 
 
 
286 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.34 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.34 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.77 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.54 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.43 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37 
 
 
279 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.9 
 
 
305 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.45 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.55 
 
 
285 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.44 
 
 
304 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.78 
 
 
285 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.01 
 
 
302 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.11 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.42 
 
 
300 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.8 
 
 
309 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.95 
 
 
289 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.71 
 
 
300 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  34.98 
 
 
285 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  28.35 
 
 
301 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.33 
 
 
288 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.84 
 
 
299 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.45 
 
 
301 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.96 
 
 
304 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.86 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.8 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>