277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1135 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
289 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.3 
 
 
289 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.3 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.27 
 
 
279 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.27 
 
 
302 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.93 
 
 
291 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.19 
 
 
304 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  40.48 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.5 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.56 
 
 
305 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.54 
 
 
279 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.4 
 
 
280 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.76 
 
 
283 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.28 
 
 
313 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.28 
 
 
313 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.39 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.41 
 
 
304 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.51 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.27 
 
 
294 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.62 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.55 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.81 
 
 
278 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.92 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.29 
 
 
308 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.87 
 
 
304 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  35.76 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.5 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.13 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  33 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.55 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.89 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.82 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.55 
 
 
276 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.82 
 
 
309 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.3 
 
 
273 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.25 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.49 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.25 
 
 
290 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.11 
 
 
288 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.77 
 
 
305 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.08 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.58 
 
 
293 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  37.91 
 
 
298 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.54 
 
 
296 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.36 
 
 
292 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.36 
 
 
292 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  36.5 
 
 
280 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.1 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.07 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.99 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.06 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  38.49 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  38.11 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.03 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.54 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.84 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.84 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.54 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.6 
 
 
304 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.85 
 
 
276 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.12 
 
 
293 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.46 
 
 
292 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.9 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  36.13 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.14 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.16 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.13 
 
 
285 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.11 
 
 
303 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.76 
 
 
340 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.18 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  31.67 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.3 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.18 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.16 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  35.02 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  32.39 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.46 
 
 
286 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.61 
 
 
290 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.46 
 
 
286 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.02 
 
 
305 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.75 
 
 
280 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.31 
 
 
294 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.14 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.94 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.6 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.27 
 
 
297 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.79 
 
 
303 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.32 
 
 
298 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  34.63 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  32.62 
 
 
297 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  32.74 
 
 
297 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  33.1 
 
 
297 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.86 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>