281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1987 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  60.29 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.23 
 
 		 278 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.4 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.96 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.73 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  55.4 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.36 
 
 		 276 aa  278  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.9 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.55 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.04 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.79 
 
 		 283 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  60.76 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.09 
 
 		 280 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.18 
 
 		 331 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.55 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.74 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.32 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  51.8 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.42 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.42 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.88 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.84 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.33 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.82 
 
 		 279 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.69 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.36 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  52.19 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  52.55 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.85 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.67 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.1 
 
 		 279 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.11 
 
 		 318 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.09 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  48.25 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.06 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.59 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.59 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.5 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.24 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.29 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.22 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.95 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  46.88 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.27 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.97 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.15 
 
 		 293 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.27 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  42.14 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.64 
 
 		 296 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.82 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.14 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.32 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.32 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.97 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  37.84 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.73 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.33 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.75 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.06 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.27 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.69 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.95 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.54 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.65 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.96 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.66 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.31 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.57 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.76 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.91 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  35.52 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.45 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.02 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.68 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.01 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.01 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.83 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.67 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.62 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.84 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.72 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  34.35 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.96 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.93 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.95 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.89 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.65 
 
 		 303 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.46 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  34.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  34.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.67 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>