285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2271 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
293 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  96.93 
 
 
293 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  86.01 
 
 
294 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  86.01 
 
 
294 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  84.64 
 
 
293 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  84.64 
 
 
294 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  85.32 
 
 
293 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  72.73 
 
 
298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.18 
 
 
299 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  71.53 
 
 
299 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  65.57 
 
 
305 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  69.26 
 
 
296 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  63.51 
 
 
296 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.72 
 
 
298 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.9 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.3 
 
 
293 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.51 
 
 
293 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.85 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.65 
 
 
276 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.74 
 
 
273 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.52 
 
 
280 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.96 
 
 
276 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.06 
 
 
279 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.02 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.12 
 
 
291 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.92 
 
 
280 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.12 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.55 
 
 
276 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  43.93 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.28 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.38 
 
 
311 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.43 
 
 
280 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.18 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  43.05 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.39 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.93 
 
 
279 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.71 
 
 
292 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.37 
 
 
292 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.46 
 
 
310 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.59 
 
 
304 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  40.4 
 
 
296 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.61 
 
 
292 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.14 
 
 
278 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.88 
 
 
340 aa  202  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.09 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  45.61 
 
 
278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.64 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.06 
 
 
283 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.36 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.36 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.38 
 
 
319 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.31 
 
 
318 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.48 
 
 
276 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.2 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.03 
 
 
239 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.41 
 
 
290 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  43.73 
 
 
278 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  43.73 
 
 
278 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  42.91 
 
 
293 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.71 
 
 
279 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.86 
 
 
292 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.85 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.16 
 
 
302 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.39 
 
 
302 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.59 
 
 
278 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.64 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.98 
 
 
304 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.99 
 
 
285 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.04 
 
 
302 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.87 
 
 
289 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.97 
 
 
305 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.83 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.46 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.46 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.66 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.63 
 
 
290 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  35.64 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.07 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.04 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.65 
 
 
309 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.43 
 
 
303 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.11 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.88 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.81 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.73 
 
 
298 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  34.65 
 
 
278 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  34.65 
 
 
278 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  27.78 
 
 
300 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  33.11 
 
 
305 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.07 
 
 
313 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.44 
 
 
307 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.07 
 
 
313 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.46 
 
 
296 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  34.13 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  34.13 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>