286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0741 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  68.17 
 
 
310 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  63.75 
 
 
331 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  61.01 
 
 
318 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.37 
 
 
319 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.6 
 
 
291 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.6 
 
 
291 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.02 
 
 
294 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.92 
 
 
280 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.08 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.99 
 
 
276 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.51 
 
 
280 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.49 
 
 
285 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  49.84 
 
 
280 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.49 
 
 
276 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.09 
 
 
279 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.68 
 
 
278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.01 
 
 
280 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.39 
 
 
283 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.01 
 
 
279 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.53 
 
 
276 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.18 
 
 
273 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  46.45 
 
 
278 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.82 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.85 
 
 
279 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.65 
 
 
278 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  45.9 
 
 
278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.53 
 
 
281 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.53 
 
 
281 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  45.57 
 
 
278 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.75 
 
 
279 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.63 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.3 
 
 
340 aa  232  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.78 
 
 
304 aa  228  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  45.9 
 
 
298 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.32 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.32 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.32 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.4 
 
 
276 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.08 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  45.75 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  43.08 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.91 
 
 
293 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.09 
 
 
296 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.38 
 
 
293 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.58 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.19 
 
 
292 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
292 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.44 
 
 
298 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.19 
 
 
293 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.5 
 
 
305 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.87 
 
 
298 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.23 
 
 
292 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.51 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.19 
 
 
293 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.73 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.69 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.59 
 
 
290 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  35.62 
 
 
296 aa  166  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.7 
 
 
292 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.42 
 
 
293 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.42 
 
 
291 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.63 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.85 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.95 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.31 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  33.02 
 
 
286 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.05 
 
 
285 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.97 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.02 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.5 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.11 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.91 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.41 
 
 
285 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.44 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.75 
 
 
285 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.56 
 
 
309 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.87 
 
 
288 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.13 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  31.96 
 
 
285 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.98 
 
 
306 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.06 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.06 
 
 
299 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.65 
 
 
304 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  28.7 
 
 
300 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  29.75 
 
 
305 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.75 
 
 
294 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.89 
 
 
303 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.5 
 
 
302 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.21 
 
 
290 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  60.24 
 
 
309 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.39 
 
 
264 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.24 
 
 
309 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>