281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2655 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  61.97 
 
 
307 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  63.7 
 
 
307 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.17 
 
 
302 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.51 
 
 
302 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.54 
 
 
304 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.12 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.14 
 
 
313 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.14 
 
 
313 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.39 
 
 
304 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.38 
 
 
306 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.64 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  40.33 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.42 
 
 
309 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.74 
 
 
294 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.49 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.49 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  35.41 
 
 
305 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.59 
 
 
303 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.34 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.34 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.18 
 
 
296 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.98 
 
 
303 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.58 
 
 
306 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40 
 
 
279 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.56 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.81 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.86 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.19 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.89 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.38 
 
 
289 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.87 
 
 
306 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.39 
 
 
305 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  35.03 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.18 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.74 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.74 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.99 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.37 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.55 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.23 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.37 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.15 
 
 
292 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.74 
 
 
288 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.48 
 
 
289 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.87 
 
 
299 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.69 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.99 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.55 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.07 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  30 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.56 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.13 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  33.78 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.7 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.49 
 
 
287 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.78 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  32.89 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  32.89 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.19 
 
 
292 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  29.31 
 
 
300 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  29.39 
 
 
292 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07010  phenazine biosynthesis-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04380)  31.21 
 
 
363 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.16 
 
 
305 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.54 
 
 
276 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.75 
 
 
280 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.62 
 
 
299 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.38 
 
 
278 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.77 
 
 
283 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.12 
 
 
296 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.01 
 
 
276 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.97 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.35 
 
 
280 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.25 
 
 
280 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.27 
 
 
299 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.56 
 
 
293 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.27 
 
 
299 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  29.91 
 
 
293 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.27 
 
 
299 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.04 
 
 
299 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.62 
 
 
299 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.55 
 
 
299 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.97 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.64 
 
 
311 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.93 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.77 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.82 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.1 
 
 
296 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.45 
 
 
294 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.46 
 
 
293 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.27 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.47 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.49 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  30.49 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.2 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.67 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>