278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2772 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  70.16 
 
 
303 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  69.18 
 
 
303 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.98 
 
 
305 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.66 
 
 
308 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.66 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.66 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.15 
 
 
306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.45 
 
 
304 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.66 
 
 
309 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.32 
 
 
309 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.32 
 
 
309 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.14 
 
 
294 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.36 
 
 
302 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.6 
 
 
304 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.72 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.92 
 
 
313 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.92 
 
 
313 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.72 
 
 
304 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  40.46 
 
 
286 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.42 
 
 
306 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.36 
 
 
302 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.74 
 
 
302 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.87 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.16 
 
 
288 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.41 
 
 
305 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.12 
 
 
307 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.24 
 
 
279 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 
291 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32 
 
 
290 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.23 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.55 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.92 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  32.44 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  32.44 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.97 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.99 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  32.23 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.65 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  32.23 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.15 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.21 
 
 
299 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.06 
 
 
289 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.89 
 
 
292 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  32.34 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  33.23 
 
 
285 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.77 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.43 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.93 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.77 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.75 
 
 
286 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.75 
 
 
286 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.46 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.24 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.64 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.8 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.12 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.36 
 
 
305 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.12 
 
 
286 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.07 
 
 
285 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
293 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.57 
 
 
299 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.21 
 
 
293 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.75 
 
 
311 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.73 
 
 
283 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.94 
 
 
289 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  30.43 
 
 
292 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.86 
 
 
310 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.36 
 
 
331 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.66 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34 
 
 
294 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33.77 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.33 
 
 
294 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.95 
 
 
299 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.33 
 
 
294 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  33.33 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.46 
 
 
292 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.8 
 
 
305 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.61 
 
 
293 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.6 
 
 
300 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  28.43 
 
 
296 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07010  phenazine biosynthesis-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04380)  30.06 
 
 
363 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.78 
 
 
293 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.8 
 
 
280 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.84 
 
 
287 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.43 
 
 
298 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  29.19 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.71 
 
 
299 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.04 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.04 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62410  hypothetical protein  30.74 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.67 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  28.03 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.41 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>