285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1932 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  60.98 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  65.35 
 
 
303 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  64.69 
 
 
303 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.29 
 
 
308 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.96 
 
 
308 aa  298  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.96 
 
 
308 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.05 
 
 
306 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.36 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.86 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.86 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.38 
 
 
294 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.74 
 
 
304 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.16 
 
 
313 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.16 
 
 
313 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.03 
 
 
304 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.27 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.93 
 
 
306 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.24 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  39.2 
 
 
286 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.66 
 
 
288 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.64 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.34 
 
 
302 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.98 
 
 
306 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.41 
 
 
302 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.96 
 
 
307 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.86 
 
 
305 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39 
 
 
296 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.13 
 
 
291 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.74 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.06 
 
 
289 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.64 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.79 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  35 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  35 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.23 
 
 
299 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.66 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  33.44 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  33.44 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.22 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.11 
 
 
292 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.86 
 
 
301 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.74 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.44 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.23 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.79 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.31 
 
 
296 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  31.15 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.59 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.09 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.13 
 
 
290 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  33.22 
 
 
292 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.08 
 
 
286 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.08 
 
 
286 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.98 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.21 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.27 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07010  phenazine biosynthesis-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04380)  31.47 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.76 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.53 
 
 
289 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  33.88 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62410  hypothetical protein  33.12 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.77 
 
 
276 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.19 
 
 
293 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.18 
 
 
278 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.45 
 
 
273 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.5 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.81 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.81 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  35.06 
 
 
298 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  31.31 
 
 
285 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  31.63 
 
 
301 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.81 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.48 
 
 
311 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5432  hypothetical protein  34.19 
 
 
284 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  34.2 
 
 
299 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.2 
 
 
299 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.85 
 
 
280 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.89 
 
 
293 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.99 
 
 
340 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.2 
 
 
299 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.2 
 
 
299 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.2 
 
 
299 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.2 
 
 
299 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.81 
 
 
299 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  28.94 
 
 
300 aa  105  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.88 
 
 
299 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.33 
 
 
296 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.39 
 
 
305 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.09 
 
 
292 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.82 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.39 
 
 
286 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.48 
 
 
299 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.48 
 
 
299 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.01 
 
 
293 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31 
 
 
298 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.28 
 
 
299 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>