283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5032 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  68.59 
 
 
278 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  68.59 
 
 
278 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  67.87 
 
 
278 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  67.87 
 
 
278 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  61.82 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.23 
 
 
278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.4 
 
 
307 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.49 
 
 
307 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.89 
 
 
306 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.1 
 
 
296 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
313 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
313 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.22 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.04 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.88 
 
 
302 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.87 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  33.99 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.74 
 
 
304 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.42 
 
 
294 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  32.77 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.64 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.78 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.83 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.99 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.88 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.31 
 
 
306 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.96 
 
 
296 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.87 
 
 
308 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.87 
 
 
308 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.74 
 
 
305 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.88 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.6 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.79 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.55 
 
 
306 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.77 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.76 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  33.22 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.56 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  31.19 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  35.45 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.69 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.92 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.63 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.22 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.88 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.88 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.23 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.95 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.67 
 
 
292 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.28 
 
 
279 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.08 
 
 
287 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.54 
 
 
292 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.4 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.99 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.97 
 
 
289 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1975  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.29 
 
 
294 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  30.24 
 
 
300 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
293 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.29 
 
 
298 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.78 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.09 
 
 
276 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.45 
 
 
293 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.29 
 
 
296 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  34.49 
 
 
298 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.93 
 
 
297 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.51 
 
 
302 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  29.93 
 
 
297 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.46 
 
 
278 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.08 
 
 
287 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.45 
 
 
286 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.68 
 
 
278 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.27 
 
 
297 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.93 
 
 
297 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.12 
 
 
299 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.49 
 
 
280 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  30.12 
 
 
299 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.16 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.69 
 
 
299 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.29 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.25 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.92 
 
 
294 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.92 
 
 
294 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.22 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.3 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.9 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.46 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.97 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  29.59 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.25 
 
 
299 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  33.56 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.3 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>