282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0253 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  86.32 
 
 
285 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  86.32 
 
 
285 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.04 
 
 
286 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  57.39 
 
 
286 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.39 
 
 
286 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  56.21 
 
 
285 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  56.06 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.21 
 
 
305 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.03 
 
 
305 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.01 
 
 
307 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.43 
 
 
304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.67 
 
 
313 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.67 
 
 
313 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.25 
 
 
307 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.21 
 
 
290 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.77 
 
 
276 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.86 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.23 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  33.23 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  34.33 
 
 
278 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.64 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1604  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.48 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.44 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.24 
 
 
293 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.14 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.27 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
279 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.55 
 
 
292 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.01 
 
 
302 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.96 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  33.92 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.9 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.57 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.45 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.58 
 
 
302 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.07 
 
 
279 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  32.88 
 
 
286 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.68 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.8 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.65 
 
 
298 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.32 
 
 
293 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  34.03 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.68 
 
 
308 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.62 
 
 
287 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.03 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.1 
 
 
288 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.68 
 
 
283 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.03 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  34.03 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.03 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.03 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30 
 
 
303 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.68 
 
 
299 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  32.56 
 
 
293 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.01 
 
 
298 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.9 
 
 
308 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.9 
 
 
308 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.56 
 
 
276 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.03 
 
 
303 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.95 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.55 
 
 
278 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.98 
 
 
291 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.07 
 
 
310 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.98 
 
 
291 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.36 
 
 
293 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.26 
 
 
283 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.25 
 
 
318 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  28.96 
 
 
292 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.95 
 
 
309 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.04 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.39 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.39 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.75 
 
 
304 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.89 
 
 
294 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  31.74 
 
 
280 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62410  hypothetical protein  33.22 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.83 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.86 
 
 
239 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.04 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.52 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.31 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.45 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.22 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.56 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.02 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.68 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.68 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.86 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.31 
 
 
305 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.77 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.77 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.28 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.79 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.74 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.53 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.07 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.21 
 
 
305 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>