284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1510 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  62.55 
 
 
280 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.79 
 
 
283 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  61.17 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  59.29 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  59.85 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.03 
 
 
278 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  62.28 
 
 
279 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  57.45 
 
 
280 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.9 
 
 
291 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.56 
 
 
291 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.45 
 
 
283 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.64 
 
 
278 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.64 
 
 
280 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.91 
 
 
280 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  54.18 
 
 
278 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.05 
 
 
294 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.37 
 
 
340 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.82 
 
 
276 aa  275  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.49 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  52.75 
 
 
278 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  52.38 
 
 
278 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.57 
 
 
276 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.85 
 
 
310 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.07 
 
 
304 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.26 
 
 
279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.27 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.64 
 
 
281 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.64 
 
 
281 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.97 
 
 
279 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.69 
 
 
318 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.64 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.97 
 
 
239 aa  244  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.28 
 
 
279 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.96 
 
 
293 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.82 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.82 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  49.3 
 
 
298 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.26 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.13 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.47 
 
 
294 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.92 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.57 
 
 
299 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.24 
 
 
293 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.67 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.08 
 
 
296 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.21 
 
 
296 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  43.55 
 
 
292 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.15 
 
 
298 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.39 
 
 
293 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.32 
 
 
298 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.58 
 
 
293 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.46 
 
 
292 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.46 
 
 
292 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.46 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.97 
 
 
292 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  38.59 
 
 
296 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.32 
 
 
290 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.21 
 
 
291 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.97 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.23 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.06 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.43 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.08 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.33 
 
 
307 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.03 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.76 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.39 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.39 
 
 
302 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  35.56 
 
 
278 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  35.56 
 
 
278 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.62 
 
 
285 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.79 
 
 
307 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  36.77 
 
 
285 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.37 
 
 
289 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.75 
 
 
302 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.55 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  35.21 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  35.21 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  37.19 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.84 
 
 
286 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.84 
 
 
286 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.27 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  36.82 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.36 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.19 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.56 
 
 
288 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.2 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.87 
 
 
298 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.6 
 
 
304 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  30.43 
 
 
300 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.81 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.88 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.2 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>