279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001406 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  64.64 
 
 
263 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.17 
 
 
263 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  54.75 
 
 
263 aa  299  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.56 
 
 
267 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.34 
 
 
270 aa  292  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.97 
 
 
270 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.06 
 
 
281 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.15 
 
 
300 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.21 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  46.97 
 
 
259 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.83 
 
 
259 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.05 
 
 
262 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.69 
 
 
258 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.8 
 
 
260 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.29 
 
 
262 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.54 
 
 
275 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.91 
 
 
262 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.05 
 
 
262 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.7 
 
 
264 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.44 
 
 
269 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.56 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.6 
 
 
287 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.8 
 
 
261 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 
261 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.86 
 
 
273 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
261 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
268 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 
270 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.18 
 
 
263 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  41.51 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  42.59 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.51 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.44 
 
 
273 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  39.16 
 
 
261 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.59 
 
 
277 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.32 
 
 
266 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  41.06 
 
 
262 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  38.78 
 
 
261 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.3 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.53 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.48 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
261 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  39.77 
 
 
265 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.47 
 
 
266 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.89 
 
 
266 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.52 
 
 
266 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.6 
 
 
263 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.42 
 
 
267 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.11 
 
 
275 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  38.02 
 
 
264 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.5 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  39.85 
 
 
266 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.7 
 
 
258 aa  159  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.11 
 
 
263 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.29 
 
 
268 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
262 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.47 
 
 
264 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  37.87 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.88 
 
 
260 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.06 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.63 
 
 
277 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.53 
 
 
273 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.21 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.48 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.03 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.34 
 
 
282 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  34.76 
 
 
210 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.28 
 
 
299 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  32.38 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  28.51 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.55 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.14 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.62 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.42 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.38 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.03 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.29 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.28 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  29.08 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.13 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.29 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  28.62 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.8 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.42 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  29.64 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  29.64 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.66 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.57 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.11 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  30.18 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  29.64 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.68 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.77 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  26.44 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.48 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  26.71 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>