51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1970 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1970  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 322 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1375  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.73 
 
 		 399 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 2651 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 927 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  42.03 
 
 		 1837 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  25.36 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 828 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 789 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  24.5 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 395 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.66 
 
 		 573 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1585  cytochrome c-type biogenesis protein  28.26 
 
 		 400 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1404 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 291 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 2262 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 722 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1548  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 398 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608789  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 366 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 		 2679 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3888  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.07 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 3145 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  24.24 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3645  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.07 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0927546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  28.36 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.27 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 566 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1297 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  24.81 
 
 		 519 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 2262 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 2240 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 193 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.66 
 
 		 573 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 187 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  37.31 
 
 		 392 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  25.58 
 
 		 367 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 871 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  37.31 
 
 		 382 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 518 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 441 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 441 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 		 466 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  46.51 
 
 		 330 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 290 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>