More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1486 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1486  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00392704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.85 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.12 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  33.02 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  30.75 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  30.12 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  32.44 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.55 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.65 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.55 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  31.06 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  30.25 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.96 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  31.45 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  31.45 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 		 339 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  32.28 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  28.66 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2704  UDP-glucose 4-epimerase  32.01 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647112  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  33.23 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.5 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  29.32 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  31.27 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  29.04 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  28.96 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  31.33 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  30.34 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  33.44 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  34.04 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  31.63 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  31.19 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.5 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  33.87 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  31.31 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  32.63 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  27.53 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  31.94 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  31.94 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  33.97 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  32.82 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  32.43 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  30.61 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3868  UDP-glucose 4-epimerase  31.53 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.955537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  27.9 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  27.9 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  33.01 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  31.93 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.5 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  30.32 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2900  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  33.03 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  29.06 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>