136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4241 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4241  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.18 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.4 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.76 
 
 		 425 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  28.57 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  26.15 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  23 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  22.64 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  22.37 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  21.72 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  22.17 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  21.79 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  26.18 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2502  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2687  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  26.94 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  22.56 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.22 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.54 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.75 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.5 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  24.12 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  23.39 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.56 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.26 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0720  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.86668  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  21.39 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.87 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.19 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.52 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  21.35 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  22.81 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2723  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000984442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  21.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.14 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.08 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.64 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  26.2 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  24.44 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.39 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  22.47 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.71 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  24.87 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  36.84 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  21.39 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  21.98 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>