More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2449 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2449  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0122  D-amino-acid dehydrogenase  73.63 
 
 
407 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.59 
 
 
425 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.71 
 
 
422 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  35.44 
 
 
401 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.95 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.04 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2467  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.71 
 
 
422 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  36.39 
 
 
416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0223  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.29 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1999  D-amino-acid dehydrogenase  36.05 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.29 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.43 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.05 
 
 
417 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  37.38 
 
 
406 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  32.9 
 
 
429 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.05 
 
 
416 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.74 
 
 
416 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.86 
 
 
416 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.49 
 
 
416 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.68 
 
 
421 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  36.05 
 
 
415 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.86 
 
 
416 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  35.56 
 
 
411 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2262  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.21 
 
 
425 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.66021  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.34 
 
 
434 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.36 
 
 
418 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.07 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.07 
 
 
434 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.07 
 
 
434 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.06 
 
 
434 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  33.91 
 
 
439 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.78 
 
 
432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.59 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.3 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  34 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4738  D-amino-acid dehydrogenase  36.88 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
418 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 
428 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.02 
 
 
434 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  32.19 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  33.66 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 
416 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.66 
 
 
429 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.29 
 
 
439 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  34.98 
 
 
419 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4441  D-amino acid dehydrogenase 2 small subunit  35.2 
 
 
417 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136724  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.99 
 
 
432 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.73 
 
 
432 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.84 
 
 
433 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 
429 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.37 
 
 
429 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  34.95 
 
 
436 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 
432 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  34.71 
 
 
436 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 
432 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
433 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2589  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.91 
 
 
426 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
434 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
434 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.91 
 
 
433 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
434 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.74 
 
 
433 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  34.22 
 
 
433 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  35.89 
 
 
443 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  33.09 
 
 
434 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.52 
 
 
432 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
434 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
434 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.62 
 
 
432 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  30.62 
 
 
417 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>