96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4783 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4783  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 334 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1396  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  39.34 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0131078  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5199  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  39.51 
 
 		 381 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7830  putative D-ribose-binding periplasmic protein precursor  38.04 
 
 		 386 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0987  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  37 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.45 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4780  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.29 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3266  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.31 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.4 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338248  normal  0.0272241 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6100  carbohydrate binding protein  24.74 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.26 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  28.57 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.05 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2644  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.5 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  27.17 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  23.64 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.12 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1798  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.92 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.35 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  29.06 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.69 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  26.45 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0934818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.97 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  24.66 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.28 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1272  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.2 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.269718  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.03 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.89 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  21.9 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5339  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  24.51 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1985  monosaccharide-transporting ATPase  24.25 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.22 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00471967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.4 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  25.09 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  26.03 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  26.79 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.11 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.99 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182523  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  25.4 
 
 		 315 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.83 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3346  ribose ABC transporter periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  23.83 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.72 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.73 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  24.52 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0273  RbsB protein  20.91 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1366  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0494  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.87 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.023475  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0686  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.57 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.98 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  24.23 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  23.98 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3227  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0308005  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0292  monosaccharide-transporting ATPase  28.94 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0278  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.11019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  24.78 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2909  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.76 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  24.38 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1252  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.25 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.63 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.38 
 
 		 521 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0994  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.28 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6094  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.09 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.4 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.14 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  24.23 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2160  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.67 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  24.38 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.38 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  24.38 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2133  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.5 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577745  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2263  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1249  ABC ribose transporter, periplasmic solute-binding protein  25.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.66 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1600  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.42 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2475  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  23.87 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2367  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  22.86 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.08 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144836  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2204  monosaccharide-transporting ATPase  24.17 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00482964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  21.58 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3130  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.78 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910041  hitchhiker  0.00277477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.33 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  24.57 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3541  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.58 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4198  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.41 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.61 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  24.33 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3345  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.83 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.88 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.56 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.53 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0947  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103002  normal  0.0230828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>