More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3724 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  92.8 
 
 		 403 aa  785    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  79.9 
 
 		 403 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  96.77 
 
 		 403 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  86.35 
 
 		 403 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 403 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  75.68 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  74.94 
 
 		 405 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  74.94 
 
 		 405 aa  614  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  74.44 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  70.15 
 
 		 404 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  73.95 
 
 		 405 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  70.82 
 
 		 404 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  71.07 
 
 		 404 aa  597  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  71.39 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  68.83 
 
 		 407 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  65.67 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 408 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  64.18 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  63.28 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  61.29 
 
 		 404 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  61.43 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  61.12 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  60.95 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  61.4 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  61 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  62.5 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  60.6 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  60.35 
 
 		 407 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  61.79 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  61.48 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  61.32 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  62.19 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  59.31 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  62.69 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  57.57 
 
 		 409 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  62.69 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 408 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  61.4 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  61.4 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  59.06 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  62.34 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 		 433 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  59.2 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 		 414 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  58.52 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  57.75 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  56.08 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  52.49 
 
 		 648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  52.24 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  50.87 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  49.28 
 
 		 608 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  51.88 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  57.99 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  50.88 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  54.25 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  47.96 
 
 		 573 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.47 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  49 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.13 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.11 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.34 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.68 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.12 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.33 
 
 		 395 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.91 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.57 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.01 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.91 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.58 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.07 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.07 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.25 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.13 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.16 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.83 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33.58 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.27 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.75 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.51 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.52 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>