More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1146 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 
421 aa  863    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  86.37 
 
 
421 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  61.32 
 
 
403 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.91 
 
 
403 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  58.72 
 
 
403 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  61.32 
 
 
405 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  58.78 
 
 
403 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  57.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  58.81 
 
 
407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  57.11 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  59.06 
 
 
405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  58.81 
 
 
405 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  58.81 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  60 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  56.8 
 
 
410 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  59.29 
 
 
403 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  59.74 
 
 
404 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  58.52 
 
 
409 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  57.76 
 
 
409 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  57.14 
 
 
403 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 
408 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 
409 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  54.77 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  57.68 
 
 
409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  55.84 
 
 
404 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  59.08 
 
 
406 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  57.22 
 
 
425 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  57.76 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  55.58 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  57.07 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  56.58 
 
 
425 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  54 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  57.18 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  57.93 
 
 
414 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  54.66 
 
 
409 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  54.16 
 
 
409 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  53.27 
 
 
407 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  57.72 
 
 
433 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  53.02 
 
 
407 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  54.59 
 
 
404 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  54.95 
 
 
404 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  56.15 
 
 
434 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  54.52 
 
 
439 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  53.45 
 
 
408 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  57.03 
 
 
462 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  56.14 
 
 
435 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  49.42 
 
 
648 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  57.29 
 
 
462 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  54.04 
 
 
407 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  53.68 
 
 
404 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  57.29 
 
 
462 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  55.56 
 
 
414 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  55.86 
 
 
433 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  54.99 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  54.04 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  54.07 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  53.79 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  48.74 
 
 
402 aa  412  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  50.12 
 
 
608 aa  413  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  53.1 
 
 
430 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  53.42 
 
 
424 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  55 
 
 
431 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  50.39 
 
 
406 aa  403  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  48.74 
 
 
401 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  49.5 
 
 
398 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  50.76 
 
 
416 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.47 
 
 
573 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  52.62 
 
 
408 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  48.59 
 
 
403 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  45.79 
 
 
400 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.4 
 
 
395 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.55 
 
 
398 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.12 
 
 
391 aa  249  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  40.91 
 
 
392 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.84 
 
 
405 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.09 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.71 
 
 
402 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.98 
 
 
397 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.8 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.81 
 
 
390 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.87 
 
 
397 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.01 
 
 
395 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.44 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.98 
 
 
388 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.18 
 
 
398 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.88 
 
 
391 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02519  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.66 
 
 
402 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.47 
 
 
397 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
397 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.67 
 
 
390 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.69 
 
 
402 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.29 
 
 
393 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.91 
 
 
394 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.66 
 
 
402 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.2 
 
 
397 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.81 
 
 
393 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
397 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
397 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.83 
 
 
389 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
396 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>