More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3755 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 407 aa  832    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  98.77 
 
 		 407 aa  824    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  60.6 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  59.6 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  58.31 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  58.6 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  56.16 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  61.92 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  61.67 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.36 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  55.17 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  59.08 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  54.93 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  56.6 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  61.65 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  54.93 
 
 		 409 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  55.31 
 
 		 409 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  59.34 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  55.17 
 
 		 409 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  60.44 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  59.34 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  57.61 
 
 		 404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  59.08 
 
 		 404 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  55.17 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  56.74 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  56.53 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  58.06 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  56.39 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  58.06 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  57.29 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  55.42 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  56.17 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  54.79 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  56.27 
 
 		 462 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  54.79 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  57.07 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  57.29 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  55.78 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  57.8 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  56.52 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  54.79 
 
 		 404 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  56.52 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  56.02 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  54.94 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  54.66 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  53.27 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  56.01 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  54.96 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  50.25 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  49.13 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  50.26 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  49.16 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  46.39 
 
 		 608 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  51.27 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  50.51 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.38 
 
 		 573 aa  365  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.63 
 
 		 403 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  43.73 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.86 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.67 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.5 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.37 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.02 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.71 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2959  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.17 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.5 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.6 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.04 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.92 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.75 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.75 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.25 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.06 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.57 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.87 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.52 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1852  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.59 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.22 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.57 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.1 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.25 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>