More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2301 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  86.37 
 
 		 421 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 421 aa  864    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  61.48 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  62.24 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.97 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  58.77 
 
 		 403 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  60.69 
 
 		 407 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  59.44 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  61.22 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  57.74 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  55.77 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  59.75 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  57.58 
 
 		 404 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  59.75 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  59.49 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  57.6 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  57.97 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  56.55 
 
 		 410 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  55.72 
 
 		 409 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  56.96 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  56.23 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  56.09 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  56.82 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  57.07 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  56.17 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  56.54 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  57.72 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  55.19 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  54.72 
 
 		 425 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  55.19 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  54.94 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  58.27 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  55.44 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  58.19 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  56.64 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  50 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  57.4 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  54.59 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  53.41 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  54.3 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  55.84 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  54.85 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  54.41 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  58.06 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  54.87 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  58.31 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  58.31 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  53.85 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  57.22 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  55.13 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  54.36 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  55.13 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  55.64 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  54.39 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  49.63 
 
 		 608 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  56.56 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  52.8 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  56.01 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  51.41 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  49.23 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  50.63 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  49.24 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  49.75 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  54.07 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  45.72 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  49.1 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  44.74 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.77 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.57 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.85 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.22 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.82 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.87 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.53 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.37 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.5 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02519  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.48 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.34 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.39 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.399455  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.28 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.57 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0481  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.16 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.78 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.52 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.26 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.93 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.32 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.97 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.4 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.29 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.76 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>