More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0516 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 416 aa  848    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  62.91 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  59.74 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  57.46 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  57.47 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  56.57 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  57.99 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  57.99 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  56.78 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  55.67 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  56.23 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  57.54 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  56.89 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  53.4 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  55.87 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  54.7 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  55.64 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  53.28 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  55.56 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  51.22 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  53.12 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  54.31 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  52.79 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  51.1 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  53.52 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  52.55 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  52.79 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  50.63 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  49.88 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  51.76 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  50.76 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  48.72 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  53.35 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  52.94 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  52.91 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  47.18 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 414 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  48.48 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  51.9 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  54.66 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  51.27 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  47.34 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  52.2 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  55.41 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  51.26 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  55.41 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  53.71 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  55.41 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  50.26 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  50.26 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  50.25 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  55.5 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  51.26 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  50.26 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  53.71 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  51.12 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  54.52 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  45.64 
 
 		 608 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  50.75 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  46.23 
 
 		 648 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  50.9 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  45.15 
 
 		 573 aa  341  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  41.37 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  41.77 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.82 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.73 
 
 		 395 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.42 
 
 		 395 aa  242  9e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.76 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.01 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.51 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.1 
 
 		 399 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.68 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.77 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.75 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.1 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.43 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.1 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.59 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.16 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.9 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.84 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.59 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.59 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.54 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.05 
 
 		 395 aa  232  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.5 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.85 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.9 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>