More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1630 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  78.13 
 
 		 407 aa  638    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 407 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  99.75 
 
 		 407 aa  834    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  77.09 
 
 		 434 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  76.3 
 
 		 409 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  97.79 
 
 		 407 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  76.59 
 
 		 424 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  60.95 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.79 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  60.86 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 		 404 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  60.55 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  61.73 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  60.95 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  59.1 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  60.95 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  56.75 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  56.5 
 
 		 409 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  55.81 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  58.56 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  56 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  56.5 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  58.17 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  57.07 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  57.53 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  55.25 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  58.52 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  57.49 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  59.16 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  57.04 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  57.04 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  57.18 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  57.46 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  54.99 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  53.1 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  56.08 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  57.49 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  55.13 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  51.54 
 
 		 648 aa  425  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  53.79 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  54.86 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  50.36 
 
 		 608 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  49.13 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  51.02 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  48.64 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  47.85 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  50.26 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  49.61 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  46.85 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  43.52 
 
 		 400 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  37.57 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.17 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.29 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.01 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.46 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.83 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.79 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.79 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.79 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.11 
 
 		 400 aa  226  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.92 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.52 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.99 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.52 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.45 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.45 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.18 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.45 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.45 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.04 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.04 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.399455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.64 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.09 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.54 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>