More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3442 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  98.54 
 
 		 414 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  78.52 
 
 		 431 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  89.73 
 
 		 414 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 433 aa  869    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  87.27 
 
 		 433 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  82.12 
 
 		 462 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  80.71 
 
 		 462 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  80.71 
 
 		 462 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  72.68 
 
 		 409 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  71.5 
 
 		 409 aa  601  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  70.52 
 
 		 409 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  71.18 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  72.73 
 
 		 409 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  70.69 
 
 		 409 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  68.97 
 
 		 409 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  69.53 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  71.43 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  67.15 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  67.07 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  66.83 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  68.83 
 
 		 430 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  65.51 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  66.08 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  62.44 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  62.69 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  62.44 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  59.65 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  64.1 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  62.78 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  61.85 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  62.09 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  62.72 
 
 		 423 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  62.78 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  62.66 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.31 
 
 		 408 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  61.27 
 
 		 407 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  59.75 
 
 		 409 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  56.53 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  56.03 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  58.85 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  58.35 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  58.54 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 404 aa  464  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  58.63 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  58.27 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  57.72 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  53.55 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  56.82 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  55.96 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  52.67 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  51.67 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  52.93 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  50.48 
 
 		 608 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  54.66 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  57.49 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  48.1 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  50.58 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  45.85 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.59 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  39.19 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.54 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.89 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.86 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.69 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.07 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.73 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.98 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.75 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.96 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.57 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.33 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.64 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.22 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.61 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.2 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.07 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.61 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.49 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2796  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.23 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.06 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.82 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.57 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.49 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.39 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.8 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.82 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>