More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3028 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  98.77 
 
 
407 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 
407 aa  833    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  60.6 
 
 
403 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  60.35 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  59.35 
 
 
403 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  58.35 
 
 
403 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  57.57 
 
 
403 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  55.42 
 
 
409 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  61.43 
 
 
405 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.57 
 
 
408 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.1 
 
 
404 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  61.18 
 
 
423 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  54.43 
 
 
409 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  60.35 
 
 
403 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  54.57 
 
 
409 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  61.4 
 
 
405 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  59.08 
 
 
408 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  54.43 
 
 
409 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  54.19 
 
 
409 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  54.19 
 
 
410 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 
405 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  54.43 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  58.82 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  56.82 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  59.34 
 
 
404 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  56.85 
 
 
404 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  54.77 
 
 
409 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  58.57 
 
 
404 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  55.17 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  56.23 
 
 
414 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  56.03 
 
 
433 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  55.67 
 
 
439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  56.14 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  57.8 
 
 
408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  56.78 
 
 
409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  54.93 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  57.54 
 
 
404 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  54.3 
 
 
425 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  59.34 
 
 
406 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  54.3 
 
 
425 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  55.75 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  55.03 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  56.68 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  56.56 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  56.68 
 
 
414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  57.29 
 
 
407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  56.01 
 
 
462 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  54.05 
 
 
404 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  56.27 
 
 
434 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  56.01 
 
 
462 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  54.99 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 
421 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  54.99 
 
 
407 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  54.99 
 
 
407 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 
430 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  54.17 
 
 
407 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  53.02 
 
 
421 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  55.75 
 
 
404 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  54.2 
 
 
424 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  49.63 
 
 
406 aa  424  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  49.13 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  49.49 
 
 
401 aa  412  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  49.16 
 
 
648 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  49.74 
 
 
398 aa  411  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  45.91 
 
 
608 aa  383  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 
416 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 
408 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  45.89 
 
 
573 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  46.88 
 
 
403 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  43.73 
 
 
400 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.11 
 
 
391 aa  246  6e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.92 
 
 
395 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 
394 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.27 
 
 
395 aa  229  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34 
 
 
398 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33 
 
 
397 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
388 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.99 
 
 
392 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
398 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.6 
 
 
390 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2959  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.92 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.59 
 
 
403 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.17 
 
 
397 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.59 
 
 
413 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.59 
 
 
403 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.77 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.25 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.8 
 
 
398 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.49 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.51 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.41 
 
 
399 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.87 
 
 
398 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.41 
 
 
399 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1852  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.59 
 
 
397 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.25 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.22 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.41 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.5 
 
 
397 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>